故事开始于戈梅拉岛上的一片森林之中,在这里,一具年轻男子的尸体被发现了,之后,一名嫌疑犯遭到了逮捕,但因为缺乏关键性的证据,最终,这名嫌犯获得了无罪判决,这桩案件也就此成为了悬案...
由於身懷特殊能力,一個名叫宮的女孩被僱傭兵追殺。在逃跑的路上,她碰巧遇到出生在忍者世家中的石動律花。這些忍者一直隱居在僻靜之地,石動律花和她的祖父兵衛,也就是忍者家族的首領,決定為宮提供庇護,但親眼看見父親被僱傭兵殺害的宮卻一心想要報仇…。